從具體操作方法分可以分為堿裂解法煮沸法牙簽法等在氫氧化鈉pH120126堿性環境和去污劑SDS的作用下，細菌蛋白質變性，細胞破裂，細菌染色體DNA變性，雙鏈DNA氫鍵斷裂，DNA雙螺旋結構遭破壞而發生變形但由于質粒DNA相對分子質量較小，公價閉環的DNA雖然變性但仍處于拓撲纏繞狀態，呈環狀超。

19純化基因治療用質粒 Q Sepharose XL，SOURCE 15Q，STREAMLINE Q，Sephacryl S500，Plasmidselect 在下游純化中，可應用不同層析技術在純化生物分子的同時，去除各種污染物 1去除內毒素 內毒素又稱熱原含脂肪A糖類和蛋白，是帶負電的復合大分子 內毒素的脂肪A部份有很強的疏水性但在高鹽下會凝集，無。